我が家でも以前同じ事象に遭遇して対処していたのですが、やはり他にも遭遇した方がいらっしゃたようで、フォーラムで質問がありました。

WHSを起動すると、

ローカルに格納されているプロファイルを読み込めません。セキュリティの権限が不足しているか、ローカル プロファイルが壊れている可能性があります。問題が解決しない場合は、ネットワーク管理者に問い合わせてください

と表示される場合があります。これはWHSにディスプレイを繋げていないと気づかないかもしれません。我が家では、アンチ
ウィルスソフトとして Forefront Client Security をWHSにインストールしています。どうもその影響でこのエラーが出ていた
のではないかと思っているのですが（再インストール後Forefrontインストール前でも発生しました）、
ダウンロードの詳細 : User Profile Hive Cleanup Service
をインストールすることで発生しなくなりました。

たぶん、ログオフ時にレジストリかプロファイルをロックしてしまっていたのではないかと想像しているのですが、これをインストールすることで、ログオフ時に強制的にリリースさせ、上記のエラーが出なくなったんだろうと思っています。
あとは、HDDにchkdskをかけると改善したという場合もあるようです。これのインストールとchkdskを併せて実施するのがいいかもしれません。